Під час утворення комплексу кумасі бриллиантового блакитного з білком реакція, що відбувається, включає наступні етапи: Барвник передає вільний електрон групам білків, які можуть бути іонізовані. Перенесення електронів до білка порушує його природну структуру та оголює його гідрофобні кишені.23 червня 2022 р
Коли білки зв’язуються з синім кумасі в кислотному розчині, їх позитивні заряди пригнічують протонування, і в результаті виникає синє забарвлення.. Зв’язування барвника з білком викликає зміщення максимуму поглинання барвника з 465 до 595 нм, і відстежується збільшення поглинання при 595 нм.
У кислих умовах барвник кумасі зв’язується з основними та гідрофобними залишками білків, змінюючи колір від тьмяно-червонувато-коричневого до інтенсивно-синього.. Як і всі інші методи фарбування, фарбування Кумасі виявляє деякі білки краще, ніж інші, на основі хімії дії та відмінностей у складі білка.
Ми виявили, що нейтральні іонні види CBB зв’язуються з білками шляхом поєднання гідрофобних взаємодій і гетерополярних зв’язків з основними амінокислотами.
ЕЛЕКТРОФОРЕЗ | Білки. Відносно висока інтенсивність фарбування кумасі синім ґрунтується на електростатична взаємодія між молекулами барвника та аміногрупами білків і, на вторинних зв’язках, взаємодія барвник між молекулами барвника.
І Ponceau S, і Coomassie Brilliant Blue є такими негативно заряджені розчини, які зв’язуються з позитивно зарядженими групами амінокислот і неполярними ділянками білка.