У мас-спектрометрії фрагментація – це дисоціація енергетично нестабільних молекулярних іонів, що утворюються в результаті проходження молекул
. Ці реакції добре задокументовані протягом десятиліть, і шаблони фрагментації корисні для визначення молярної маси та структурної інформації невідомих молекул.
Відбувається фрагментація коли енергетично нестабільні молекулярні атоми дисоціюють (через гомолітичне або гетеролітичне розщеплення), коли вони проходять через іонізаційну камеру мас-спектрометра.
Іонізація молекули в молекулярний іон всередині мас-спектрометра викликає нестабільність у структурі молекули через втрату електрона. Це зрештою призводить до фрагментації або розриву деяких зв’язків у молекулі.
Фрагментація — форма нестатевого розмноження, де фрагмент батька відривається і розвивається в абсолютно нову, але генетично ідентичну особину. Батько потім регенерує або відрощує шматок, який відколовся, тож зрештою з одного виходить дві нові особини.
Спирти. Спирти піддаються фрагментації в мас-спектрометрі двома шляхами: альфа-розщеплення та зневоднення. На шляху α-розщеплення найближчий до гідроксильної групи зв’язок C–C розривається, утворюючи нейтральний радикал плюс резонансно стабілізований кисневмісний катіон.
Багато факторів впливають на фрагментацію, перш за все в мас-спектрометрії кількість піків фрагментів, загальні іони фрагментів і структуру, а також виявлення значень маси до заряду (m/z).